UNIDAD DE GENÓMICA

SERVICIOS

• SECUENCIACIÓN:
  • Secuenciación automática de ADN.
  • Secuenciación de variantes genéticas asociadas a cáncer familiar.
  • Identificación molecular de microorganismos.
  • Diseño de primers.
    
    
• ANÁLISIS DE FRAGMENTOS:
  • Resolución de productos de PCR por tamaño.
  • Huella genética.
  • Diseño de primers.
    
    
• PCR A TIEMPO REAL:
  • Análisis de la expresión génica (placas de 96 y de 384 pocillos).
  • Arrays de baja densidad (Tarjetas microfluídicas).
  • Genotipado con sondas TaqMan®.
  • HRM (Melting de alta resolución).
  • Análisis de datos.
  • Diseño de primers y sondas.
    
    
• TECNOLOGÍA DE MICROARRAYS:
  • Fabricación de microarrays de ADN de diferente grado de densidad mediante impresión de muestras (productos de PCR y oligonucleótidos) en vidrio tratado.
  • Marcaje Cy3/Cy5 de muestras experimentales para hibridación. Hibridación y lavados de microarrays mediante estación de hibridación automatizada.
  • Lectura de microarrays.
  • Análisis de imágenes y obtención de datos básicos.
  • Análisis de expresión génica y otras aplicaciones con tecnología GeneChip-Affymetrix.
  • Análisis de expresión génica con tecnología CodeLink-GE HealthCare.
    
    
• DIAGNÓSTICO MOLECULAR EN CÁNCER FAMILIAR:
  • Cáncer de colon hereditario no polipósico.
    1. Secuenciación completa del gen MLH1.
    2. Secuenciación completa del gen MSH2.
    3. Secuenciación completa del gen MSH6.
       
  • Cáncer de mama.
    1. Identificación de mutaciones recurrentes en BRCA1/BRCA2.
    2. Secuenciación completa del gen BRCA1/BRCA2.
       
  • Otras patologías hereditarias.
    
    
• IDENTIFICACION GENÉTICA HUMANA (HUELLA GENÉTICA):
  • Identificación de 16 marcadores con Identifiler AmpFLSTR®.
    
    
• IDENTIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS:
  

  • Secuenciación de rRNA 500/1000 pb bacterias.
  • Secuenciación de rRNA 500 pb hongos.
  • Identificaión en BB.DD.

EQUIPOS DISPONIBLES

SEDE CANTOBLANCO

• Secuenciador multicapilar ABI Prism 3730 (Applied Biosystems).
• Secuenciador multicapilar ABI Prism 3100 (Applied Biosystems).
• Secuenciador multicapilar ABI Prism 3700 (Applied Biosystems).
• Sistema ABI Prism 7000 (Applied Biosystems).
• Sistema ABI Prism 7900 HT (Applied Biosystems).
• Biomek 2000 (Beckman Coulter).
• Sistema 9700 GeneAmp (Applied Biosystems).
• Secuenciador multicapilar AB 3730XL (Applied Biosystems).
• Sistema 9800 Fast ThermCycler PCR (Applied Biosystems) .
• SDS SW V2.X Enterprise Edit.
• LightCycler 480^® (Roche Diagnostics).

SEDE MONCLOA

• Dos secuenciadores multicapilares ABI Prism 3730 (Applied Biosystems).
• Sistema ABI Prism 7700 (Applied Biosystems) de PCR cuantitativa en tiempo real con capacidad para 96 muestras y lectura simultanea de 4 fluoróforos.
• Robot Microgrid II (Biorobotics) para impresión de microarrays de ADN con una densidad de 20.000 puntos.
• Bioanalizador 2100B (Agilent Technologies).
• Estación de Hibridación Lucidea Slice Pro (Amersham Biosciences) para procesos de hibridación y lavado de microarrays de ADN.
• Escáner GenePix 4000B (Axon Instruments) para lectura y obtención de datos de hibridación en microarrays de ADN
• Escáner Scanarray 4000 (Packard BioChip Technologies).
• Molecular Imager FX ProPlus (BioRad).
• Robot Biomek 2000 (Beckman Coulter) para manejo de líquidos: automatización de procesos de PCR y secuenciación de ADN.
• Equipo Affymetrix para hibridación, tinción y lectura de microarrays de ADN (GeneChip Scanner 3000, Fluidics Station 450, Hybridization Oven 640).
• Espectrofotómetro ND-100 (NanoDrop).
• Sistema AB 7900 HT Fast Real PCR (Applied Biosystems), PCR cuantitativa en tiempo real (cofinanciado con fondos FEDER).
• Sistema AB 9700 GeneAmp PCR (Applied Biosystems).

DATOS DE CONTACTO