UNIDAD DE PROTEÓMICA

SERVICIOS

• DETERMINACIÓN DE MASAS MOLECULARES DE PROTEÍNAS Y PÉPTIDOS MEDIANTE ESPECTROMETRÍA DE MASAS (MALDI-TOF).
  
• IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS MEDIANTE HUELLA PEPTÍDICA:
  • Digestión enzimática de proteínas aisladas a partir de geles de 2-DE, SDS-PAGE (1-D) o en solución, de forma automatizada o manual.
  • Análisis de los péptidos mediante espectrometría de masas tipo MALDI-TOF. Obtención del mapa o huella peptídica.
  • Búsqueda en bases de datos para la posible identificación de la proteína.
    
    
• IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS MEDIANTE HUELLA PEPTÍDICA Y POSTERIOR FRAGMENTACIÓN DE PÉPTIDOS (MALDI-TOF-TOF):
  • Digestión enzimática con tripsina de proteínas aisladas a partir de geles 2-DE, SDS-PAGE (1-D) o en solución, de forma automatizada o manual.
  • Análisis de los péptidos mediante espectrometría de masas tipo MALDI-TOF. Obtención del mapa o huella peptídica.
  • Secuenciación automática de péptidos (de 1 a 3 péptidos) (MS/MS).
  • Búsqueda y posible identificación de la proteína mediante huella peptídica (datos MS), mediante la(s) secuencia(s) de péptidos (datos MS/MS), o combinando ambas técnicas (MS + MS/MS).
  • Búsqueda automática e identificación mediante el sistema GPS (Global Protein Server) acoplado a los datos del TOF-TOF.
    
    
• SECUENCIACIÓN DE PÉPTIDOS MEDIANTE ESPECTROMETRÍA DE MASAS EN TANDEM:
  • MALDI-TOF-TOF.
  • Q-TOF.
  • Trampa de iones lineal LTQ.
    
    
• SEPARACIÓN DE PROTEÍNAS MEDIANTE ELECTROFORESIS MONODIMENSIONAL, SDS-PAGE.
  
  
• SEPARACIÓN DE MUESTRAS COMPLEJAS DE PROTEÍNAS MEDIANTE ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL, 2D-PAGE y ROTOFOR:
  • 2D-PAGE: técnica basada en la separación de las proteínas en función de dos parámetros: su punto isoeléctrico, pI (Isoelectroenfoque, IEF) y su peso molecular (Electroforesis en condiciones desnaturalizantes, SDS-PAGE).
    
  • ROTOFOR: permite la separación de proteínas según su PI (Punto Isoeléctrico).
    
    
• IDENTIFICACIÓN DE PROTEÍNAS PRESENTES EN MUESTRAS DE COMPLEJIDAD BAJA Y MEDIA (<50 PROTEÍNAS) MEDIANTE CROMATOGRAFÍA LÍQUIDA CAPILAR ACOPLADA A ESPECTROMETRÍA DE MASAS (nanoHPLC-MALDI-TOF/TOF):
  • Digestión en solución.
  • Separación de los péptidos generados mediante nano-HPLC en fase reversa.
  • Deposición directa sobre una placa de MALDI-TOF/TOF.
  • Búsqueda automática e identificación de proteínas a partir de secuencias peptídicas (espectros MS/MS) mediante Global Protein Server (GPS).
    
    
• ESTUDIO DE EXPRESIÓN DEFERENCIAL MEDIANTE FLUOROCROMOS, DIGE:
  • Técnica de reciente implantación para estudios de expresión diferencial de proteínas.
  • Las condiciones a estudiar se marcan con distintos fluorocromos.
  • Alta reproducibilidad. Mismas condiciones experimentales para todos los geles.
  • Análisis de datos mediante el software DeCyder.
    
    
• ANÁLISIS DE MEZCLAS COMPLEJAS DE PROTEÍNAS O SUBPROTEOMAS MEDIANTE CROMATOGRAFÍA LÍQUIDA ACOPLADA A ESPECTROMETRÍA DE MASAS.
  

EQUIPOS DISPONIBLES

• Espectrómetro de Masas con Fuente de Ionización MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization) y analizador tipo tiempo de vuelo (TOF) , modelo Voyager DE-STR Biospectrometry Workstation con un Voyager 2 GHz Acquisition System y CID (Cámara de Colisión) para trabajo en modo PSD (Applied Biosystems).
• Espectrómetro de masas tandem de cuadrupolo-tiempo de vuelo con sistema de cromatografia liquida capilar (LC-MS-MS), modelo Q-TOFII (Micromass).
• Espectrómetro de masas 4700 Proteomics Analyzer con TOF/TOFTM , con fuente de ionización tipo MALDI y dos analizadores tipo tiempo de vuelo en tandem y cámara de colisión (CID) para fragmentación de iones (Applied Biosystems).
• Digestor Multiple probe 215 liquid handler y Turbo Vap 96 Workstation (Amersham Bioscience).
• Sistema EttanTM para Electroforesis Bidimensionales, 2D-PAGE.
• Robot para la excisión de manchas de geles de electroforesis bidimensional.
• Escaner de fluorescencia Typhoon 9400.
• Sistema de medida automática de interacciones biomoleculares, modelo Biacore 3000
• Sistema de espectrometría de masas de trampa iónica lineal segmentada de alta precisión modelo Thermo Finnigan LTQ.
• Sistema de cromatografía líquida (nano-HPLC) que permite la separación multidimensional off-line, acoplado a un recolector de microfracciones (LC Packings).
• Espectrómetro de masas 4700 Proteomics Analyzer con TOF/TOFTM , con fuente de ionización tipo MALDI y dos analizadores tipo tiempo de vuelo en tandem y cámara de colisión (CID) para fragmentación de iones (Applied Biosystems).
• Digestor Multiple probe 215 liquid handler y Turbo Vap 96 Workstation (Amersham Bioscience).
• Sistema LCMSD tipo HPLC - trampa de iones, modelo LCQ-DecaXPplus (Thermo Finnigan).
• Sistema de Búsqueda Automática e Identificación de muestras GPS (Global Proteomic Server) Applied Biosystems.

DATOS DE CONTACTO